Sequel kinowego przeboju z 2003 roku o przygodach młodego agenta. Tym razem Cody wyjeżdża do Londynu, gdzie ma za zadanie odzyskać ukradzione przez nielojalnego szpiega CIA specjalne urządzenie pozwalające kontrolować ludzkie umysły. Działając pod przykrywką studenta elitarnej szkoły, chłopiec infiltruje środowisko w poszukiwaniu podejrzanych oraz swojego głównego celu. Korzysta nie tylko z pomocy nowego asystenta - Dereka, ale również całej gamy najróżniejszych szpiegowskich gadżetów.

Frankie Muniz powraca jako Agent Cody Banks w nowej misji. Jeden z agentów CIA wykrada ściśle tajne urządzenie do kontrolowania umysłu. Zadaniem Cody'ego jest odzyskanie wynalazku. W tym celu wyjeżdża do Lodnynu, gdzie podaje się za studenta elitanej szkoły muzycznej. Działając w ukryciu, Cody nie tylko musi na czas odnaleźć skradzione urządzenie, ale również ukrywać swoją prawdziwą tożsamość przed innymi uczniami szkoły, co nie jest zadaniem łatwym, zważywszy na fakt, że uczęszcza na zajęcia z gry na skrzypcach. Korzystając z pomocy najnowocześniejszych gadżetów Cody toczy walkę z czasem - musi odzyskać urządzenie zanim światowi przywódcy znajdą się pod kontrolą ohydnego przestępcy.

Cody Banks to pozornie nieśmiały nastolatek. Nikt nie wie, że kilka lat temu CIA zwebrowało go w szeregi oddziału najmłodszych agentów do zadań specjalnych. Pierwsze poważne zadanie, mimo początkowych kłopotów Cody wypełnił w 150 procentach. Ratując cały arsenał strategiczny USA, genialnego naukowca Conorsa, a przede wszystkim jego piękną córkę Natalię. Od tej pory jego akcje w rządowej agencji znacznie wzrosły.
Teraz staje przed kolejnym wielkim wyzwaniem. Musi jechać z tajną misją do stolicy Wielkiej Brytanii. Jeden z pracowników CIA skadł tajne urządzenie, które pozwala kontrolować ludzkie umysły, i najprawdopodobniej ukrywa sie w Londynie. Cody Banks wyrusza do akcji podając się za studenta elitarnej szkoły muzycznej. W zadaniu pomaga mu nowy, bardzo oryginalny asystent Derek. Młodzi agenci korzystają też z całego arsenału najnowocześniejszych szpiegowskich gadżetów. Muszą wygrać wyścig z czasem i odzyskać wynalazek, zanim zostanie on użyty do zmanipulowania umysłów światowych przywódców.